综合台湾媒体报道，台北地检署6日指挥检察事务官兵分七路，搜索“国防部”副部长柯承亨、“外交部长”黄志芳住处等地，目前行动正在持续进行中。至于是否搜索同案被告“行政院”副院长邱义仁住处，检方以行动仍进行中为由，不愿意对外说明。

　　本案关系人吴思材在侦讯时，提供一份收取佣金名单给检方，此外，黄志芳也提供检方一份不同版的名单，让这起“外交”丑闻可能变成贪污丑闻。由于“行政院”副院长邱义仁表示，他曾向陈水扁报告“建交”事情经过，加上金援10亿元是个大数字，邱义仁一定会上大签，陈水扁多少一定知道部分过程，因此检方将以证人身份传唤陈水扁厘清案情，至于是在520卸任前或卸任后传讯，检方不愿透露。

　　此外，“外交部”亚太司长李传通也被传在七人收贿名单之内，5日他被检方约谈后，表示“完全没有外交部人员接受任何贿款，我可以百分之百的肯定。”但对于是否有其他部门的官员收贿，他则是以“无可奉告”带过。不过他也透露，黄志芳日前说派人陪同金纪玖赴新加坡取款，但是就他了解，根本“没有外交部任何官员陪同”，供词与黄志芳的说法明显矛盾。

　　黄志芳日前表示，2006年12月下旬，“外交部”官员硬押着金纪玖到新加坡，希望把钱汇回到台北，金纪玖以小孩生病为由，私自离开下榻饭店且失联，他于是启动外交危机处理机制；但是李传通却表示，金纪玖如何到新加坡再转赴大陆，摆脱台湾司法的追查，他根本不知情，也绝对没有陪同金纪玖赴新加坡。

　　由于本案疑点重重，不仅官员的话彼此兜不拢外，现在连疑似行贿名单也出现闹双胞，除了吴思材交出一份外，黄志芳也交出一份据称是正本的名单，里面都以姓氏或代号书写，同时后面跟着一笔金额。这份包括邱义仁、黄志芳、柯承亨、吴思材、金纪玖、王广德等七名官商的名单，牵涉金额总计1000万美元。

　　台湾“外交部”于2006年8月与金纪玖、吴思材达成口头协议，委托两人担任中间人，与巴布亚纽几内亚谈判“建交”，并同意在两人于新加坡华侨银行设立的联名户头，由“外交部”存入三千万美元，作为向巴布亚纽几内亚提供技术援助的经费。这笔款项遭到侵吞，台湾“外交部”已经在新加坡委托律师追讨，台北检方也已分案侦办。